青芝寺位於福建省連江縣城南約10公裏的青芝山。青芝山在連江縣官司頭鎮，原名“百洞山”。山上多奇石怪洞，因產靈芝得名青芝山。前人有詩讚：“寺產靈芝聞海外，山稱百洞重江南。”此山開闢於明萬曆天啟年間(1621-1627年)。經曆代脩建已成一大名勝風景區。山中的鬆、巖、峰、巒、泉、洞，天然成趣。山水秀麗，有“一百零八景”之稱，其中較著者有五峰、十洞、十六巖、三十五石及一湖、三泉、三檯、三室。山中青芝寺，建於明萬曆年間(1573-1620年)，由朝廷董尚書主持興建。清光緒十三年(1887年)重建後殿，1934年林森重脩前殿。外觀似西式樓房，內部則是中國傳統建築的殿宇，風格別緻。四賙有梅花樓、鬆風閣、嘯餘廬、藏骨塔、第一亭、半山腰、栩園、慕園、觀光亭、同樂亭等亭檯樓閣十餘處;並有數十處古代崖刻，有篆、隸、楷、行、草等字體，以明朝萬曆年間宰輔葉嚮高的草書詩刻最為著名。　青芝寺著名的祖師為覺非禪師，傳承法係為臨濟宗。寺院現存主要彿教建築有中西閤璧風格的大雄寶殿、大悲樓、觀音大士殿、玉彿洞、三聖殿等。該寺最重要的文物是由一整棵楠木彫刻的彿像及九世班禪送給林森先生供奉的白玉彿，均被寺僧視為鎮山之寶。
    本寺自明朝建寺以來，一直隻有一二僧人住持。光緒年間，興福禪師興建大士殿，僧人多至十五人，後漸衰落。至1984年10月，界脩法師從中國彿學院畢業後住持青芝寺，興建東西兩客堂，住僧十五人，1990年，界賢法師應界脩法師之邀前來住持青芝寺，先後蓋起大悲閣、選賢樓、玉彿閣等，住眾二十人。